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中国农业科学院棉花研究所行业标准：棉花品种真实性鉴定SSR分子标记法
棉花品种 真实性鉴定 SSR 分子标记法
2024/5/16
本标准规定了利用简单重复序列（Simple sequence repeat, SSR）分子标记法进行棉花（Gossypium spp L.）品种真实性检测的术语和定义，缩略语，原理，检测方案，仪器设备、试剂和溶液配制，检测程序，鉴定意见和结果报告。
本发明涉及分子检测领域，特别地关于用于鉴别杂交棉品种中棉1279的SSR引物对及其产品以及鉴别方法。用于鉴别杂交棉品种中棉1279的SSR引物对，包括以下中的任一种或多种：NAU2836上下游引物、BNL3255上下游引物、NAU1233上下游引物、NAU2671上下游引物、NAU1070上下游引物、CIR043上下游引物、BNL1154上下游引物、NAU3675上下游引物。本发明以共设计182对...
中国农业科学院棉花研究所专利：用于构建中棉所50指纹图谱的SSR引物及其应用
中棉所50 指纹图谱 SSR引物
2024/4/22
本发明公开了用于构建中棉所50指纹图谱的SSR引物及其应用，属于中棉所50的分子生物学鉴定领域。本发明根据GenBank dbEST数据库及专业棉花数据库CMD上释放获得的棉花EST序列数据设计并初步筛选获得268对SSR引物。本发明在上述268对引物中筛选获得106对具有差异效果的引物。本发明进一步对上述106对引物进行筛选，选出差异较为稳定、多态性好的15对核心引物，加上一对Bt基因特异引物，...
中国农业科学院棉花研究所专利：用于构建陆地棉品种指纹图谱的SSR引物及其应用
陆地棉品种 指纹图谱 SSR引物
2024/4/22
本发明公开了用于构建陆地棉品种指纹图谱的SSR引物及其应用，属于陆地棉品种的分子生物学鉴定领域。本发明根据GenBank dbEST数据库及专业棉花数据库CMD上释放获得的棉花EST序列数据设计并初步筛选获得268对SSR引物。本发明利用中棉所6个杂交种的6对亲本对所设计引物的扩增效果进行筛选，结果其中有106对引物具有差异效果。本发明进一步对上述106对引物进行筛选，选出差异较为稳定、多态性好的...
本发明涉及一种棕色棉纤维色泽主效QTL连锁的SSR分子标记及用途，属于植物分子遗传学和彩色棉种质技术领域，本发明所提供的棕色纤维色泽主效QTL的分子标记的两个引物，标记NAU5235和标记NAU3496进行PCR扩增，检测扩增产物中有270bp片段和310bp片段。通过已知的染色体进行锚定，将主效QTL位点定位在第15号染色体上。同时，本发明的两个分子标记皆可用于检测其纤维色泽或者其后代的纤维色泽...
中国科学院武汉植物园“一种快速鉴定罂粟的SSR试剂盒”获国家发明专利授权
罂粟的SSR试剂盒 专利授权 植物资源
2022/10/27
2022年4月26日，从国家知识产权局获悉，中国科学院武汉植物园药用植物资源学科组的“一种快速鉴定罂粟的SSR试剂盒”获国家发明专利授权。专利号：ZL201910362343.5。发明人：梁琼；杨路路；张燕君；袁芳。
2021年2月10日，从国家知识产权局获悉,中国科学院武汉植物园的发明专利“用于鉴定泰国莲种质的SSR分子标记及应用” （ZL 201911080230.2）获国家发明专利授权。发明人：杨美、杨东、宋贺云、刘艳玲、邓显豹。
【目的】利用已获得的纳米孔长读段测序数据完善现有的蜜蜂球囊菌Ascosphaera apis参考基因组注释信息，并对未注释的新基因和新转录本进行鉴定和功能注释。【方法】基于已获得的纳米孔长读段测序数据，采用gffcompare软件将蜜蜂球囊菌全长转录本与参考基因组注释的转录本进行比较，进而对参考基因组注释基因的非翻译区(untranslated region, UTR)进行延长。利用TransDe...
基于表型性状及分子标记对丽江不同油橄榄品种进行遗传多样性分析,对品种鉴定及育种工作均有重要意义。以云南丽江主要栽培的19个油橄榄品种为试验材料,利用14个表型性状(5个叶片性状和9个果实性状)及20个SSR引物荧光标记进行多样性及聚类分析。结果表明,各品种油橄榄表型性状存在显著差异,20个SSR位点共检测到124个等位基因变异,平均每个位点等位基因数为6.2个,利用表型性状及SSR荧光分子标记可完...
基于SSR标记的不同优势等级云南松遗传多样性分析
优势等级 遗传多样性 云南松
2019/5/27
基于SSR分子标记技术，按树高和胸径（地径）因子将样地内的植株分为优势木、中等木和劣势木3类，对不同生长优势等级云南松林木的遗传多样性变异特征进行了研究。结果表明：在林冠层，优势木的有效等位基因数、Shannon's信息指数、观测杂合度和期望杂合度分别为2.083、0.762、0.290和0.423，略高于中等木和劣势木；在更新层，有效等位基因数、Shannon's信息指数、观测杂合度和期望杂合度...
基于SSR分子标记的酸浆属植物亲缘关系研究
酸浆属 亲缘关系 SSR分子标记
2018/6/7
近年来, 由于营养价值高、果实可当水果食用且具有潜在的药用价值, 酸浆属(Physalis)植物在全球范围内受到了越来越多的关注。采用SSR分子标记技术对我国范围内主要分布的4种酸浆属植物的22份样品进行了亲缘关系研究, 结果表明, 20对SSR引物共扩增出118个位点, 其中107个(90.7%)为多态性位点; 平均种间遗传相似系数为0.501。UPGMA聚类和PCoA分析结果得出相似结论, 并...
龙眼顶芽转录组简单重复序列(SSR)标记信息分析及分子标记开发
龙眼 转录组 SSR
2018/11/26
随着新一代测序技术的发展, 大量的转录组数据和表达序列标签(EST)成为开发简单重复序列(SSR)标记的可利用资源。本研究利用MISA软件筛选龙眼(Dimocarpus longan)顶芽转录组数据库序列, 从114 445条龙眼转录组unigene序列中发现11 546个SSR位点, SSR出现频率为10.09%。其中1 975条unigene含有两个或两个以上EST-SSR位点, 占所有SSR...
小黑杨基因组的初步组装及SSR信息分析
小黑杨 基因组 SSR
2019/5/27
小黑杨是人们以小叶杨和欧洲黑杨为亲本培育出的杂交种，兼具双亲生长速度快、抗性强的优点。本研究通过二代测序技术，对小黑杨进行全基因组测序，初步组装出小黑杨基因组，并以此为基础，识别分析其SSR序列，为小黑杨品种划分、表型性状关联等提供参考。结果表明，共组装得到了366 876条总计368.96 Mbp的contig序列；对其中不小于2 000 bp的21 788条的非冗余contig进行SSR分析，...
越橘属植物EST-SSR分子标记开发及遗传多样性分析
越橘 分子标记 EST-SSR 遗传多样性
2018/11/23
以84份越橘种质为材料, 从NCBI公共数据库下载22 402条越橘属(Vaccinium) EST序列, 通过CAP3组装软件将EST序列拼接成11 541条unigene序列, 其中2 076条unigene序列含有2 679个SSR位点。二核苷酸和三核苷酸重复是主要的SSR类型, 约占SSR总数的96.01%。利用Primer Premier 5.0软件设计81对引物, 其中55对引物在供试...