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中国农业科学院棉花研究所行业标准：棉花品种真实性鉴定SSR分子标记法
棉花品种 真实性鉴定 SSR 分子标记法
2024/5/16
本标准规定了利用简单重复序列（Simple sequence repeat, SSR）分子标记法进行棉花（Gossypium spp L.）品种真实性检测的术语和定义，缩略语，原理，检测方案，仪器设备、试剂和溶液配制，检测程序，鉴定意见和结果报告。
本发明涉及一种棕色棉纤维色泽主效QTL连锁的SSR分子标记及用途，属于植物分子遗传学和彩色棉种质技术领域，本发明所提供的棕色纤维色泽主效QTL的分子标记的两个引物，标记NAU5235和标记NAU3496进行PCR扩增，检测扩增产物中有270bp片段和310bp片段。通过已知的染色体进行锚定，将主效QTL位点定位在第15号染色体上。同时，本发明的两个分子标记皆可用于检测其纤维色泽或者其后代的纤维色泽...
2021年2月10日，从国家知识产权局获悉,中国科学院武汉植物园的发明专利“用于鉴定泰国莲种质的SSR分子标记及应用” （ZL 201911080230.2）获国家发明专利授权。发明人：杨美、杨东、宋贺云、刘艳玲、邓显豹。
基于SSR分子标记的酸浆属植物亲缘关系研究
酸浆属 亲缘关系 SSR分子标记
2018/6/7
近年来, 由于营养价值高、果实可当水果食用且具有潜在的药用价值, 酸浆属(Physalis)植物在全球范围内受到了越来越多的关注。采用SSR分子标记技术对我国范围内主要分布的4种酸浆属植物的22份样品进行了亲缘关系研究, 结果表明, 20对SSR引物共扩增出118个位点, 其中107个(90.7%)为多态性位点; 平均种间遗传相似系数为0.501。UPGMA聚类和PCoA分析结果得出相似结论, 并...
越橘属植物EST-SSR分子标记开发及遗传多样性分析
越橘 分子标记 EST-SSR 遗传多样性
2018/11/23
以84份越橘种质为材料, 从NCBI公共数据库下载22 402条越橘属(Vaccinium) EST序列, 通过CAP3组装软件将EST序列拼接成11 541条unigene序列, 其中2 076条unigene序列含有2 679个SSR位点。二核苷酸和三核苷酸重复是主要的SSR类型, 约占SSR总数的96.01%。利用Primer Premier 5.0软件设计81对引物, 其中55对引物在供试...
通过转录组测序技术鉴别普通油茶(Camellia oleifera) EST-SSR位点, 开发筛选适用于普通油茶种质资源评价与利用的多态性SSR标记, 对普通油茶的遗传变异研究和油茶良种的分子标记辅助育种具有重要意义。利用 MISA 工具从普通油茶转录组67 434条Unigenes (63.39 MB)中筛选得到26 751个包含1~6个核苷酸重复类型的SSR位点, SSR的分布频率为39.6...
【目的】通过RNA seq技术对纯培养的蜜蜂球囊菌Ascosphaera apis孢子和球囊菌侵染的蜜蜂幼虫肠道组织进行测序，de novo组装球囊菌的参考转录组，并对其进行功能与代谢通路注释，进而基于该转录组数据开发球囊菌的SSR分子标记。【方法】首先通过差速离心获得活化的球囊菌孢子，配制含1×107孢子/mL的饲料饲喂4，5和6日龄的意大利蜜蜂Apis mellifera ligustica幼...
2015年12月4日由中国科学院武汉植物园张琼副研究员、黄宏文研究员、刘春燕博士生、钟彩虹研究员、龚俊杰研究员共同发明的“用于猕猴桃杂交群体雌雄性别鉴定的SSR分子标记A003（ZL 201410523043.8）获国家发明专利授权。
柑橘EST-SSR分子标记分析
柑橘 EST 微卫星 SSR
2008/2/8
摘要对来源于甜橙（CitrussinensisOsbeck）、枳壳(PoncirustrifoliataRaf.)和其他柑橘非冗余EST数据库的38124条单一基因（Unigene）序列进行了简单重复序列SSRs(SimpleSequenceRepeat)搜索，所分析的柑橘非冗余核酸序列总长23.29Mb，从中获得了8218条SSR，其中包括单碱基重复4913条（59.8%）,2碱基重复1419条...
摘要采用Genomic-SSR和EST-SSR标记技术，对来自我国北方冬麦区的18份普通小麦品种（系）的遗传多样性进行了探讨，并与系谱遗传距离进行了比较分析。研究发现，平均每个Genomic-SSR检测到的等位基因数为3.34个，明显高于EST-SSR的2.31个。遗传距离（GD）计算结果显示，18个小麦基因型之间的EST-SSR平均遗传距离较小，仅为0.3996，低于Genomic-SSR的GD...
玉米P25自交系抗锈病基因的遗传分析及SSR分子标记定位
玉米 南方型锈病 主基因-多基因混合模型 SSR 定位
2008/2/1
摘要 摘要：以玉米南方型锈病免疫自交系P25和感病自交系F349及F1、F2、B1和B2为材料，采用主基因-多基因混合遗传模型研究了P25的抗病遗传规律。结果表明：自交系P25的抗病基因为一主基因，表现为加性效应，没有检测出多基因，其在F2、B1和B2群体的遗传率分别为81.88%、38.14%和55.1%。利用SSR分子标记技术，以组合P25×F349的F2:3家系作为构图群体，构建了玉米SSR...
我国西南地区玉米地方品种遗传多样性的SSR分子标记分析
遗传多样性 玉米地方品种 SSR标记
2008/1/24
摘要利用微卫星（SSR）标记技术和DNA混合取样方法，选取均匀覆盖玉米染色体组的42对SSR引物，检测了来自我国西南地区54个玉米地方品种的遗传多样性。在54个玉米地方品种中检测到256个等位基因，每个SSR标记的平均等位基因数为2-9，平均为6.1；根据遗传相似系数矩阵做出的树状图，将54个玉米地方品种大致划分成4类，来源于同一地区的多数玉米地方品种划分在同一类中。从54个玉米地方品种中选出11...
SSR分子标记检测出的花生类型内遗传变异
花生 SSR 遗传多样性 区别指数
2008/1/21
花生是我国重要的食用油和蛋白质来源作物, 鉴定其DNA分子多态性对品种改良和资源评价具有重要的意义。从已公布的花生Genomic-SSR和EST-SSR引物中筛选出34对引物, 用来分别鉴定花生4大类型各24份共96份品种资源的分子变异, 其中龙生型资源全部来自广西, 普通型资源中有11份从国外引进, 有13份来自广西和国内其他省市, 多粒型资源只有两份来自中国, 其他22份分别来自印度、美国和非...
我国陆地棉基础种质遗传多样性的SSR分子标记分析
基础种质 SSR 遗传多样性
2007/12/7
摘要利用398对BNL、JESPR 、TMB等SSR引物，对不同亲本来源、不同选育时期、不同种植生态区的43份陆地棉基础种质进行了遗传多样性的SSR分子标记分析。扩增产物用8%的非变性聚丙烯酰胺凝胶检测,银染观察并照相。遗传多样性带型分析按位点多态信息量（PIC），Shannon-weaver多样性指数（H’）等方法，利用NTSYSpc2.1软件计算品种间的遗传相似系数（Jaccard系数），并用...