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近日，上海科技大学iHuman研究所、生命科学与技术学院水雯箐课题组在《分子与细胞蛋白质组学》（Molecular & Cellular Proteomics）发表了题为“Acquisition and Analysis of DIA-Based Proteomic Data: A Comprehensive Survey in 2023” 的综述论文，对近二十年数据非依赖型采集（data-ind...
中国科学院遗传发育所在植物磷酸化蛋白质组学技术研发方面获进展（图）
遗传发育 植物磷酸化 蛋白质
2023/12/5
蛋白质磷酸化是在激酶催化下将磷酸基团转移到底物蛋白质上的可逆过程，是能够调控蛋白质结构与功能且参与细胞内信号转导的重要翻译后修饰，在植物的生长、发育、环境适应以及作物的产量和品质调控中发挥着重要作用。深度解析磷酸化蛋白质组，是探讨磷酸化如何参与这些生物学过程以及筛选与作物重要农艺性状相关的关键磷酸化靶点的有效手段。然而，与动物相比，植物磷酸化蛋白质组的深度解析在技术上更具挑战性。这是由于植物细胞具...
蛋白质磷酸化是在激酶催化下将磷酸基团转移到底物蛋白质上的可逆过程，是一种能调控蛋白质结构与功能并参与细胞内信号转导的重要翻译后修饰，在植物的生长、发育、环境适应以及作物的产量和品质调控中发挥着重要的作用。深度解析磷酸化蛋白质组是理解磷酸化如何参与这些生物学过程以及筛选与作物重要农艺性状相关的关键磷酸化靶点的有效手段。然而，与动物相比，植物磷酸化蛋白质组的深度解析在技术上更具挑战性。因为植物细胞具有...
一种基于胰蛋白酶催化的N端稳定同位素编码的氨基酸标记的相对定量蛋白质组学方法。蛋白质在水相缓冲溶液中经过胰蛋白酶酶解冻干后，转移到含微量水的乙醇体系中，又在胰蛋白酶的催化下将稳定同位素编码的精氨酸连接到这些肽段的N末端。该酶促标记温和的反应条件以及高度区域专一性大大减少了肽段降解和副反应的发生。由于新的肽键也能在串联质谱中解离，所以新形成的其他碎片离子能大大提高的肽鉴定的准确度。通过应用于标准蛋白...
近期，中国科学技术大学科技考古实验室关于古蛋白质组学性别鉴定的最新研究进展发表于中国科学院古脊椎动物与古人类研究所主办的人类学领域期刊《人类学学报》。基于古蛋白质组学这一新兴技术，研究从中国不同地区、不同时代及不同保存情况的牙釉质样本中成功提取釉原蛋白，并进行了性别鉴定。该方法以其便捷高效、成功率高等优点有望大规模应用于古代人类遗骸的性别鉴定。
Journal of Agricultural and Food Chemistry|海南大学李海燕团队基于比较蛋白质组学解析了液泡膜转运蛋白对盐碱胁迫耐受的正调控作用机制（图）
蛋白质组学 液泡膜 转运蛋白 盐碱胁迫 耐受正调控
2023/12/15
大豆（Glycine max (L.) Merrill）起源于我国，是世界第一大植物蛋白质和第二大食用植物油脂来源，在国民经济发展和保障国家粮食安全中具有重要地位。值得注意的是，随着人民生活水平的提高，豆粕和豆油需求不断增加，大豆进口量连年增长，自给率仅为15%左右，已成为我国大豆在国际竞争中“卡脖子”的关键因素。然而，大豆作为中度盐敏感型作物，当土壤中盐碱度超过5 dS/m时，大豆产量即可降低5...
基于超高分辨率液质联用质谱的定量蛋白质组学已成为重要的生命科学研究手段。与其他组学方法一样，恰当的数据分析流程是蛋白质组学研究的关键。基于质谱的蛋白质组数据具有方法仪器多样、搜库定量软件繁多的特点，导致下游的数据处理分析更为困难繁琐，亟需发展可高效处理多样的蛋白质组学数据的下游分析工具。
广州健康院开发定量蛋白质组学数据的下游分析与可视化工具（图）
蛋白质 数据分析
2023/11/8
基于超高分辨率液质联用质谱的定量蛋白质组学已成为重要的生命科学研究手段。与其它组学方法一样，恰当的数据分析流程是蛋白质组学研究的关键。基于质谱的蛋白质组数据具有方法仪器多样、搜库定量软件繁多的特点，导致下游的数据处理分析更为困难繁琐，亟需一个可高效处理多样的蛋白质组学数据的下游分析工具。
本发明涉及一种可实现蛋白质定量分析前处理全过程的新型固相萃取(SPE)装置，该装置利用隔板将SPE管分隔为两个等体积的腔室，装填色谱填料后，可原位实现蛋白质样品变性、还原、烷基化、酶解、同位素标记和混合等定量蛋白质组学中样品处理的全过程。该装置制作简便，制作成本低，处理样品时具有回收率高、易操作、定量结果准确度好，精密度高等优点。
蛋白质作为疾病生物标志物和药物靶点在现代生物医学中具有举足轻重的作用，蛋白质组学是分析生物体内所有蛋白质的组成与定量的有效手段。传统的蛋白质组检测的是整块组织或分离后的细胞中的蛋白表达水平，失去了空间位置信息。然而，由于组织异质性，组织中不同细胞表达的蛋白种类和数量可能存在显著性差异，获得组织空间定位的蛋白表达图谱有助于解析组织微环境、肿瘤异质性，并在疾病的精细化诊断、药物选择及预后评估等方面发挥...
近日，中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分离分析新材料与新技术研究组（1809组）叶明亮研究员、秦洪强研究员团队开发了表征蛋白质中组氨酸残基反应活性的蛋白质组学分析新方法。该工作筛选并获得了具有组氨酸优异反应效率的α, β-不饱和醛探针，发展了基于烯醛探针的组氨酸标记技术和可逆酰肼化学富集方法，通过蛋白质组定量技术实现了人类蛋白质组中的组氨酸反应活性的高效表征。
β-地中海贫血是一种由β-珠蛋白基因（HBB）突变引发的遗传性血液性疾病。据统计，全球约1.5%的人口为β-地中海贫血携带者，我国发病率较高的地区为广西、广东、海南等。其中，广西人口携带率高达6.43%，是影响社会发展和民生福祉改善的重大公共卫生问题。
广东省农业科学院农业生物基因研究中心以第一署名单位在国际权威学术期刊Green Chemistry（中科院1区TOP，IF=11.034）在线发表以“An eco-friendly, low-cost, and automated strategy for phosphoproteome profiling”为题的研究成果。广东省农业科学院农业生物基因研究中心作物品质控制与多组学技术创新团队在磷酸...
2020年9月，广东省林业科学研究院野生动物保护研究团队参与研究的《combined proteomics and transcriptomics reveal the genetic basis underlying the differentiation of skin appendages and immunity in pangolin》一文在《Scientific Reports》上发表...
