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单细胞测序揭示囊性包虫病不同阶段内皮细胞和免疫细胞异质性
囊型包虫病 皮细胞 免疫细胞异质性
2023/2/22
囊型包虫病（CE）是一种由细粒棘球绦虫幼虫—原头节感染引起的严重人兽共患病，呈全球性分布，为我国重点防控的传染病。表现为寄生的组织器官（主要是肝脏和肺部）中的包囊充满大量原头节（PSCs），如囊壁破裂原头节可播散至其他部位，导致继发感染，是囊型包虫病手术后复发的主要原因。
PBJ |安徽农业大学宋传奎教授团队通过茶树单细胞测序发现儿茶素糖苷化证据 （图）
茶树 单细胞测序 儿茶素 糖苷化
2023/4/20
茶树是重要的木本叶用型园艺作物，其鲜叶制作而成的茶叶因其独特的风味和天然化合物深受人们喜爱。茶树中风味相关次生代谢产物积累是茶叶独特风味形成的物质基础，如儿茶素，特别是酯型儿茶素是茶的苦涩味的来源之一，茶氨酸是茶叶鲜爽的来源。随着茶树基因组解析，茶树中主要次生代谢合成与调控机制研究上取得瞩目的成果，但深入到细胞层面的生物合成与分布却鲜有报道。
单细胞转录组测序目前已成为生物学研究中的核心技术手段，其能够帮助研究人员获得组织样品中单细胞水平的基因表达信息。然而，传统的单细胞测序流程需要先将组织消化为单细胞悬液，这一过程会造成细胞空间位置信息的丢失。已有的空间分辨单细胞转录组原位测序技术往往受限于低空间分辨率、低通量和高背景等问题。近日，北京大学化学与分子工程学院陈兴课题组、黄岩谊课题组与北京大学第一医院杨莉课题组合作开发了一种全新的空间分...
科技日报讯 （记者赵汉斌）猪体节数量性状是猪遗传育种的重要研究方向之一。记者11月底从中国科学院昆明动物研究所获悉，该所张亚平院士研究团队与合作者通过单细胞测序，进行了猪胸腰椎发育和肋骨发生过程中的细胞类群鉴定与发育阶段胸腰椎的基因差异表达分析。国际期刊《基因组学、蛋白质组学和生物信息学》发表了这一成果。
中国科学院遗传与发育生物学研究所戴建武再生医学团队长期从事脊髓损伤再生修复研究。其研发的NeuroRegen支架经过长达5年的临床研究随访被证明安全有效，实现了脊髓损伤再生修复产品0到1的突破。 戴建武研究组与南京鼓楼医院胡娅莉教授团队，首次通过单细胞转录组技术对早孕及中孕时期的人胚胎脊髓进行了分析。
上海交通大学等利用单细胞测序技术解析胆囊癌图谱
胆囊癌图谱 单细胞测序 肿瘤微环境
2021/7/30
上海交通大学医学院教授王慧、研究员巴乾团队和复旦大学中山医院教授刘厚宝团队合作，利用单细胞测序技术全面解析了胆囊癌图谱，分别从癌细胞异质性、肿瘤微环境细胞浸润等方面全面表征了胆囊癌组织的疾病特征，为胆囊癌中免疫微环境功能解析及治疗方案的研究提供了新视角。
广东省农业科学院作物研究所花生单细胞测序取得重要进展（图）
花生单细胞基因 料经济作物 栽培
2022/3/25
2021年7月22日，作物所科技人员在国际著名期刊《Plant Biotechnology Journal》 （JCR一区，IF9.803）在线发表花生单细胞基因表达研究成果，在国际上首次绘制了花生叶片单细胞基因表达图谱。作物所刘浩博士，联合培养研究生胡冬秀、杜普旋为共同第一作者。作物所洪彦彬研究员、陈小平研究员，国际半干旱热带作物研究所Rajeev Varshney院士为共同通讯作者。
广东省农业科学院作物研究所作物所花生单细胞测序取得重要进展（图）
花生单细胞测序 四倍体栽培
2022/3/16
2021年7月6日，广东省农业科学院作物研究所作物所科技人员在国际著名期刊《Plant Biotechnology Journal》 （JCR一区，IF9.803）在线发表花生单细胞基因表达研究成果，在国际上首次绘制了花生叶片单细胞基因表达图谱。作物所刘浩博士，联合培养研究生胡冬秀、杜普旋为共同第一作者。作物所洪彦彬研究员、陈小平研究员，国际半干旱热带作物研究所Rajeev Varshney院士为...
广东省农业科学院作物所花生单细胞测序研究取得重要进展 （图）
花生单细胞测序 经济作物 栽培种花生
2022/4/10
2021年7月5日，广东省农业科学院作物所科技人员在国际著名期刊《Plant Biotechnology Journal》 （JCR一区，IF9.803）在线发表花生单细胞基因表达研究成果，在国际上首次绘制了花生叶片单细胞基因表达图谱。作物所刘浩博士，联合培养研究生胡冬秀、杜普旋为共同第一作者。作物所洪彦彬研究员、陈小平研究员，国际半干旱热带作物研究所Rajeev Varshney院士为共同通讯作...
基于数字微流控技术 我国简化单细胞测序方法
基因组学 数字微流控技术 单细胞测序
2022/3/9
基因组学已经成为生命科学与医院研究的常用方法。从人类基因组计划开始，我们已经完成了数千种生物的全基因组测序，初步分析了他们的基因组结构。然而，目前基因组学分析技术通常需要大量的样品才能进行全基因组测序，而对于微生物以及一些复杂的情况，我们只能获得数量极其有限的细胞甚至只有单个细胞进行测序。此时就需要利用单细胞全基因组测序(WGS)技术。
我国科学家开发新技术，极大提高单细胞测序性能
科学家 单细胞 测序性能 全基因组测序
2021/1/12
单细胞全基因组测序（WGS）对于表征DNA中动态细胞间变化至关重要。当前用于单细胞WGS的样品制备技术复杂，昂贵，并且存在高扩增偏差和误差。2020年12月9日，厦门大学杨朝勇团队在Science Advances 在线发表题为“Digital-WGS: Automated, highly efficient whole-genome sequencing of single cells by d...
2020年7月15日，上海交通大学医学院上海市免疫学研究所李斌课题组在Science Bulletin上发表了题为"Single-cell RNA-seq unveils critical regulators of humanFOXP3+ regulatory T cell stability”的论文，应用单细胞技术，揭示了炎症环境下Treg细胞异质性，发现并验证了CYP1A1是Treg细胞功能...
2020年11月3日，北京脑重大疾病研究院主办的“他山之玉”基础研究临床转化系列讲座活动，邀请到北京大学汤富酬教授，做了题为“利用单细胞测序技术探索人类发育和疾病的奥秘-从信息生物学视角研究人类生物学”的在线专题讲座。
在新冠肺炎疫情爆发初期，中国科大生命科学与医学部魏海明教授与中国科大附属第一医院徐晓玲教授迅速组成联合攻关团队，提出了传统药物托珠单抗联合常规治疗的“科大方案”并展开临床实验，该方案由于可靠的疗效被纳入新冠诊疗方案第七版，已被20多个国家采用。近日，中国科学技术大学生命科学与医学部瞿昆教授团队在《自然·通讯》（Nature Communications）杂志发表题为“Single-cell ana...
生物通单细胞测序胶质母细胞瘤的异质性（图）
单细胞；深入剖析；胶质母细胞瘤
2022/1/25
胶质母细胞瘤是中枢神经系统最常见的原发恶性肿瘤，患者中位生存期为14-16个月。在开发有效的治疗方法时，人们遇到的一大障碍是肿瘤异质性。胶质母细胞瘤不仅在不同个体之间存在异质性，在肿瘤内部同样存在异质性。对此，人们的了解还很有限。