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旨在克隆和分析水貂酪氨酸酶（tyrosinase，TYR）基因编码区，揭示该基因编码区SNPs及其皮肤组织mRNA差异表达规律与水貂毛色表型的关系。本研究采集7月龄雄性金州黑水貂、名威银蓝水貂和红眼白水貂共计301个样本的血液，利用聚合酶链式反应（PCR）方法对水貂TYR基因5个外显子进行分段克隆，并拼接获得其完整编码区序列（coding sequence，CDS）；采用PCR产物直接测序技术筛查...
猪囊等孢球虫孢子化与未孢子化卵囊的差异表达蛋白质组学分析
猪囊等孢球虫 孢子化卵囊 未孢子化卵囊 iTRAQ
2021/3/12
通过比较猪囊等孢球虫孢子化卵囊与未孢子化卵囊的差异表达蛋白质，以期从蛋白质组学角度研究其发育机制，并为此类球虫的发育机制及该病的免疫预防或化学防治找到新的“关键”分子奠定基础。首先建立哺乳仔猪的猪囊等孢球虫感染模型，然后运用iTRAQ技术，结合LC-MS/MS分析差异表达蛋白质，并采用荧光定量PCR验证iTRAQ数据。结果共鉴定出174个蛋白，差异表达蛋白40个，其中38个蛋白上调表达，2个蛋白下...
胚胎附植是影响母猪产仔数的一个重要因素，本研究旨在找到猪胚胎附植的关键调控基因。选用5～7胎次梅山猪母猪4头，在其妊娠第18和24天分别屠宰2头，采集其卵巢组织进行转录组测序（RNA-seq）分析，GO功能富集分析及Pathway分析。结果表明：1）猪胚胎附植中期卵巢（卵_18 d）和后期卵巢（卵_24 d）两个组织样检测到的表达基因中最多的序列（reads）均为外显子序列；卵_18 d测得rea...
旨在筛选鸡不同部位（背部和腿部）皮肤组织中的差异表达基因，探讨二者皮肤毛囊出现表型差异的分子机制。以处于上市日龄的（63日龄）商品代肉鸡为素材，利用Agilent鸡全基因组表达谱芯片对皮肤厚度、毛囊密度和直径出现显著差异的背部和腿部皮肤组织mRNA表达水平进行检测，对与皮肤毛囊发生发育相关的候选基因及信号通路进行系统筛查，并运用实时荧光定量PCR技术对部分差异表达基因进行验证。结果显示，芯片分析共...
旨在鉴定分析水牛乳腺泌乳期和非泌乳期miRNA的表达谱和差异作用机制。采集水牛泌乳期和非泌乳期乳腺组织，利用Solexa测序技术构建2个时期miRNAs表达谱，鉴定前体miRNAs、成熟miRNAs和新miRNAs，分析miRNAs的第一偏好性核苷酸和染色体分布，发掘水牛泌乳期和非泌乳期高表达及差异表达miRNAs。结果显示，本研究构建了水牛泌乳期和非泌乳期乳腺组织2个miRNA表达谱，分别获得1...
研究半番鸭与番鸭精巢组织转录组差异表达基因，为进一步阐明半番鸭不育的遗传机制奠定理论基础。【方法】利用转录组测序方法对半番鸭和番鸭的精巢组织进行研究，筛选其差异表达基因，并对其功能进行注释和荧光定量PCR(quantitative real-time PCR, QRT-PCR)验证。【结果】测序共获得43.84Gb Clean Data，组装后共获得193 535条Unigene。DESeq分析发...
蒙古马高负荷运动训练前后转录组差异表达分析
蒙古马 高负荷运动 转录组
2017/7/12
旨在对蒙古马高负荷运动训练前后转录组差异表达进行分析。本试验对6匹进行了4个月高负荷运动训练的蒙古马进行研究，分别在训练前后两个时期采集肌肉样品，利用二代测序技术对肌肉样品建立转录组文库，对发生显著变化的差异基因进行GO功能富集和KEGG Pathway分析，寻找训练前后发生显著变化的代谢通路及相关候选基因。结果表明，在转录组筛选到的1 102个显著差异表达基因中，有299个在训练后发生下调，80...
基于RNA-Seq筛选鸭肠炎病毒感染鸭脾差异表达免疫相关基因
脾 差异表达 免疫相关基因
2017/4/1
为挖掘鸭肠炎病毒(duck enteritis virus，DEV)感染鸭的差异表达免疫相关基因，本研究以DEV GZ株经腿部肌肉接种50 d鸭后，于接种后66、90和114 h采集鸭脾组织样本，提取总RNA，通过高通量RNA-seq技术测序，应用GO和KEGG数据库进行比对注释，并采用荧光定量PCR对部分差异表达基因进行验证，结果显示：DEV接种66 h时鸭脾的差异表达基因有511个，参与免疫相...
扩展莫尼茨绦虫wnt基因在虫体不同发育体节的差异表达
扩展莫尼茨绦虫 节片发育 wnt基因家族 差异表达
2016/12/26
研究扩展莫尼茨绦虫（Moniezia expansa）wnt基因家族wnt1、wnt2、wnt4、wnt5和wnt11B 5个基因在虫体不同发育体节的差异表达及组织分布规律，为进一步揭示Wnt信号通路在扩展莫尼茨绦虫发育中的作用奠定基础。作者采用SYBR GreenⅠqRT-PCR方法分析了wnt1、wnt2、wnt4、wnt5和wnt11B在虫体头颈节、幼节、成节和孕节的mRNA相对转录情况；采...
作者采用定量蛋白质组学方法，对猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）感染猪肺泡巨噬细胞（PAMs）和正常PAMs的蛋白质组进行差异分析。通过高效液相色谱和电喷雾串联质谱仪定量分析PRRSV感染细胞与未感染对照细胞间的差异表达蛋白质，并运用Max-Quant 1.0.7.4软件结合蛋白质数据库PaxDb进行鉴定。与对照组相比，感染组共鉴定出39个差异表达蛋白质，其中30个蛋白质表达上调，9个蛋白质表达...
细粒棘球绦虫原头蚴（PSC）具有双向发育的特点，本文旨在利用SSH和生物信息学方法筛选原头蚴包囊（CW）和成虫（AW）特异性的基因。将PSC-CW和PSC-AW双相发育差减cDNA文库的差减PCR产物克隆入pGEM-T载体并测序，利用CAP3 sequence assembly在线软件、Blast2GO软件与GenBank数据库对测序结果进行分析，筛选原头蚴成囊和成虫特异性的基因，并探讨这些基因的...
旨在探讨突触融合蛋白4（Syntaxin4，STX4）在皮肤组织细胞中的表达与定位，确定其是否与毛色形成存在相关性。选择白、灰、黑3种毛色皮肤组织样品（6只昆明小鼠白毛色背部皮肤、6只C57BL/6小鼠灰毛色腹部皮肤和黑毛色背部皮肤）和体外培养小鼠黑色素细胞样品，通过PCR扩增、Real-time PCR、免疫组化和Western blot 技术对STX4的表达情况进行定性和定量分析。结果表明：在...
对生长速度长期的高压选择导致了快大型肉鸡与优质型地方鸡显著的表型差异，本研究旨在研究这种表型差异的分子遗传机理。采用Agilent鸡全基因组表达谱芯片对达到性成熟的优质型清远麻鸡（112 d）和快大型科宝肉鸡(42 d)比目鱼肌中与肌纤维发育和类型组成相关的候选基因及信号通路进行系统筛查。结果，芯片分析共筛选到差异倍数在2倍及以上的基因1 318个，以科宝肉鸡作为参照，清远麻鸡中上调基因501个，...
内皮素3在不同毛色绵羊皮肤中的差异表达
内皮素3 皮肤 绵羊
2015/12/2
本研究旨在探讨内皮素3在绵羊皮肤毛色中的作用。采用实时荧光定量PCR、Western blotting和免疫组织化学对内皮素3在黑色和白色绵羊皮肤中的表达差异进行分析。实时荧光定量PCR结果显示，内皮素3在黑色绵羊皮肤中的相对表达量较高，是其在白色绵羊皮肤中的表达量的2.89倍，且差异极显著（P<0.01）；Western blotting结果显示，内皮素3在黑色绵羊皮肤总蛋白中的表达量极显著高于...