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DNA加合物损伤可以由多种外源因子诱导产生，包括阳光中的紫外线、顺铂等化疗药物、香烟和汽车尾气中的苯并芘以及来自霉变食物的黄曲霉素B1等。它们会干扰DNA复制和转录，诱导突变和细胞死亡，最终导致癌症及其它疾病。
浙江大学生命科学研究院2022年5月30日黄俊实验室在Nucleic Acids Research上发文报导了RNF4调控复制叉翻转及维持基因组稳定性的分子机制（图）
黄俊 复制叉翻转 维持基因 分子机制
2022/10/25
2022年5月30日，浙江大学生命科学研究院黄俊实验室在Nucleic Acids Research杂志上在线发表了题为“RNF4 controls the extent of replication fork reversal to preserve genome stability”的研究论文，揭示了细胞调控复制叉翻转及维持基因组稳定性的分子机制。
Alastair Murchie-陈东戎课题组《Nucleic Acids Research》报道Twister核酶的新生物学功能（图）
环状RNA 陈东戎课题组 生物学 肠血吸虫病
2023/4/14
核酶指有催化功能的RNA。Twister核酶是生物信息学揭示的天然自剪切核酶，分布广泛且催化效率高，被应用于核糖开关、环状RNA表达载体等分子工具的研究，但目前Twister核酶的天然生物学功能未知。
浙江大学生命科学研究院2021年6月14日任艾明实验室在Nucleic Acids Research发文阐明黄嘌呤核开关复合物结构及调控机制（图）
任艾明 黄嘌呤核 开关复合物 金属离子介导
2022/10/25
2021年6月14日，浙江大学生命科学研究院任艾明课题组与奥地利因斯布鲁克大学Ronald Micura课题组合作在Nucleic Acids Research杂志上发表题为“Insights into xanthine riboswitch structure and metal ion-mediated ligand recognition”的研究论文，报道了特异性结合黄嘌呤的天然核开关NMT...
浙江大学生命科学研究院2021年6月9日方东实验室在Nucleic Acids Research发文阐明H3K36me2甲基转移酶NSD1在活性增强子区域内调控机制（图）
甲基转移酶 神经细胞瘤
2022/10/25
H3K36甲基化是生物体内重要的组蛋白修饰之一。其中H3K36me3的研究较多，主要在基因区富集，功能包括调控转录起始[1]，pre-mRNA的剪切，异常转录的抑制，RNA m6A修饰和DNA修复等。而H3K36me2目前研究较少，在基因区和基因间区都有富集，通常与其他组蛋白修饰协同调控基因的表达。之前的研究发现NSD1介导的H3K36me2可以抑制全基因组内H3K27me3的扩增[2]，从而间接...
与RNA和蛋白质一样，DNA具备酶的活性，尽管这一特性目前只在体外得到确认。在DNA的众多酶活特性中，可水解切割DNA的DNA（DNA水解自切酶）因其具备作为新型基因编辑工具的潜能受到更多关注。现有的DNA水解自切酶都是从人工合成的包含随机序列（N）的单链（ss）DNA文库中筛选得到的；大约十年前，耶鲁大学的Breaker团队建立了一套强大的体外筛选策略，借助环化酶CircLigase催化线性DN...
黄胜林课题组《Advanced Science》和《Nucleic Acids Research》揭示环形RNA癌症特异表达和作用并构建RNA剪接位点数据库（图）
环形RNA 癌症 肽 生物学
2023/4/17
RNA 剪接（RNA splicing）是真核生物 RNA 转录后加工的必要环节，是导致转录组多样性和复杂性的关键步骤。不同的 RNA 剪接方式可产生不同类型的剪接位点，包括线性剪接位点、反式剪接位点（环形RNA）和融合位点（融合基因）。因此，一个基因往往可产生多种形式的转录本，阐明转录本的具体信息，是了解基因结构和功能机制的重要基础。其中，环形RNA是一类具有特殊环状结构的RNA分子。目前研究表...
细胞的命运决定受到转录因子与表观遗传因子的协同调控，例如胚胎干细胞的多能性维持，既需要关键转录因子的正确结合（如OCT4, SOX2, NANOG等），又需要对启动子和增强子活性的精确调控，两者密不可分。它们如何协同作用是亟需解决的科学问题。基因的启动子、超级增强子和过度活化的增强子上，都会有组蛋白甲基化H3K4me3及附近的H3K4me1的共同存在。那么这两种甲基化状态，到底是不同的甲基化酶催化...