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近日，《海南雪茄烟种质资源SNP指纹图谱及身份证》由中国农业科学技术出版社正式出版发行。该书由海南省烟草公司海口雪茄研究所高级农艺师吕洪坤和中国农业科学院烟草研究所副研究员张兴伟、助理研究员刘国祥等编著。
研究烟草种质资源的遗传背景，为烟草种质资源的高效利用提供依据。采用GBS （genotyping-by-sequencing）技术，挖掘92份烟草种质资源的SNP位点，并进行遗传多样性和遗传结构分析。结果表明，测序共获得了147.165 Gb数据，平均每个样本1.599 Gb，筛选后共获得93 685个高质量的SNP位点；不同地理来源烟草群体等位基因数（Na）为1.27~1.93，观测杂合度（Ho...
基于RAD重测序技术开发烟草品种SNP位点
烟草 限制性内切酶位点标签 重测序 单核苷酸多态性
2019/8/15
限制性内切酶位点标签（RAD）技术，通过对10份供试烟草材料的基因组简化重测序，发掘了烟草高通量SNP位点，为烟草基因组学提供标记信息。结果表明，本研究共获得了44.33 Gb的Clean data数据，平均覆盖度1.01 X，共鉴定到291 770个SNP位点，SNP位点间的平均间距为10.066±29.801 kb。发掘到的SNP位点能够覆盖整个基因组，但在不同染色体部位上的分布密度存在一定差...
SNP genotyping by DNA photoligation: application to SNP detection of genes from food crops
biosensors DNA recognition ligation reactions
2010/1/19
We describe a simple and inexpensive single-nucleotide polymorphism (SNP) typing method, using DNA photoligation with 5-carboxyvinyl-2'-deoxyuridine and two fluorophores. This SNP-typing method facili...