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中国科学院昆明动物研究所石磊课题组合作研究揭示DNA甲基化在树鼩大脑二态性进化方面的贡献（图）
石磊 进化 基因 遗传
2024/12/2
树鼩是一种广泛分布于中国和东南亚的小型哺乳动物，因其高脑重比，被认为是最接近灵长类动物的哺乳动物，适于作为新的模式物种在神经科学领域进行研究。表观调控关键因素DNA甲基化在基因表达、X染色体失活等调控过程中均发挥重要作用，但目前利用树鼩开展DNA甲基化表观遗传机制方面的研究还较少，因此研究树鼩大脑的DNA甲基化模式有助于进一步理解表观调控在灵长类大脑进化中的作用，同时提高树鼩作为模式物种的实用性。
近日，上海科技大学生命科学与技术学院孙博课题组在学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)发表了题为“CRISPR-AsCas12f1 couples out-of-protospacer DNA unwinding with exonuclease activity in the sequential target cleavage”（CRISPR-AsCas12f1结...
DNA作为一种优异的自组装材料在指导纳米颗粒的精确和可编程组装方面被广泛探究。其中，一元体系是理论上进行自组装的最简洁设计。这种各向同性的设计允许溶液中的所有构建块以相等的可能性结合，同时也简化了在外部刺激下基本单元组装行为的调节过程。然而，因为单体合成过程很难与组装过程严格解耦，从而导致对组装的不精准控制，所以一元体系很少被采用。
DNA右手双螺旋结构的提出开启了分子生物学新篇章1。事实上，除右手双螺旋结构外，还存在其他非经典DNA构象，如三链体DNA（triplex DNA）。三链体DNA是由单链DNA通过胡斯坦氢键（Hoogsteen hydrogen bonds）与双链DNA的大沟特异性结合形成的一种三链结构2。该结构在基因组中广泛分布，发挥重要的基因调控作用，并可导致基因组不稳定性。基于以上功能，三链体形成寡核苷酸（...
近日，上海科技大学生命科学与技术学院孙博课题组与广州医科大学附属妇女儿童医疗中心李卫课题组合作在国际学术期刊《自然-通讯》（Nature Communications）在线发表题为“RPA transforms RNase H1 to a bidirectional exoribonuclease for processive RNA-DNA hybrid cleavage”（RPA转变RNase...
中国科学院动物所等开发出低DNA用量、无扩增的PacBio建库技术（图）
动物 基因 检测
2024/7/18
基因组信息在生命科学研究中具有重要价值。基于三代长读长的测序组装越来越广泛地应用于基因组学研究。其中，PacBio高保真测序技术因高精度的测序质量被认为是三代测序的金标准。然而，PacBio标准建库方法需要大量DNA输入，限制了其在小型昆虫或珍稀样本中的应用。DNA扩增虽然可以降低样本输入量，但会引入扩增偏好和人工嵌合序列等错误，影响基因组的完整性以及变异检测的准确性。因此，亟待开发低DNA用量、...
基因组信息在生命科学研究中具有重要价值。随着价格的下降，基于三代长读长的测序组装越来越广泛地应用于基因组学研究(Nat Methods 2022;Nat Rev Gene 2024)；其中，PacBio高保真（High-fidelity,HiFi）测序技术因其高精度的测序质量被认为是三代测序的金标准。然而，其标准建库方法需要大量DNA输入（>1 μg），限制了其在小型昆虫或珍稀样本中的应用(Pro...
2024年7月4日，国际学术期刊Nature Methods在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）陈玲玲研究组关于CRISPR-dCas12a应用于DNA活细胞标记的最新研究进展：“CRISPR array-mediated imaging of non-repetitive and multiplex genomic loci in living cells”...
2024年6月27日，微生物技术国家重点实验室主任、德国国家工程院院士、欧洲科学院院士张友明受邀做客鳌山讲坛，作题为“DNA重组工程技术的创新及应用”的专题报告。青岛校区党工委副书记宋作标主持报告会。
提速2倍！DNA比对新算法研发成功（图）
DNA比对 新算法 研发成功
2024/8/23
近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所农业基因组学技术研发与应用创新团队提出DNA比对新算法，并研发出DNA比对软件“BSAlign”。相比同类并行算法，新算法能够更快生成最优比对结果，且准确度更高。相关研究成果发表在《基因组蛋白质组与生物信息学报（Genomics, Proteomics & Bioinformatics）》上。
国家自然科学基金委员会中国学者在DNA转座子多样性研究和基因工程技术开发方面取得进展（图）
基因工程 细胞 遗传 元件
2024/8/25
在国家自然科学基金项目（批准号：32325014）等资助下，中国科学院动物研究所张勇课题组与王皓毅课题组开展合作研究，在DNA转座子多样性研究和基因工程技术开发方面取得进展。研究成果以“人源细胞130个DNA转座子的异源性调查揭示其功能多样性并扩展基因工程技术工具箱（Heterologous survey of 130 DNA transposons in human cells highligh...
自1948年Barbara McClintock首次报道转座子以来1，这类跳跃遗传元件对宿主演化的重要意义逐渐被揭示2-5。其中，DNA转座子作为主要类型之一，长期以来备受关注。然而，由于以往多为个案研究，DNA转座子活性的决定因素与进化模式的一般规律尚不清晰。不仅如此，尽管DNA转座子可作为基因工程工具用于插入诱变或转基因载体6,7，但目前只有Sleeping Beauty（SB）等少数几种转座...
中国水产科学研究院珠江所对鱼类DNA 条形码数据库的开发取得进展（图）
数据 基因 种质资源
2024/6/8
2024年6月5日，珠江水产研究所观赏渔业研究室在国际学术期刊《Database》（JCR 1区，IF2022=5.8）在线发表“CoSFISH: a comprehensive reference database of COI and 18S rRNA barcodes for fish”的研究论文。该研究得到了中国-东盟海洋合作基金（CAMC-2018F）、2022年省级乡村振兴战略专项种业...
本发明提供了一种以RNA介导的特异性突变FecB基因获得基因编辑绵羊的方法及其专用sgRNA和Oligo DNA，能够特异的靶向修饰绵羊FecB基因的系统包括两个sgRNA和三个Oligo DNA序列，其中，两个所述sgRNA为sgRNAFecB？1和sgRNAFecB？2，为序列表的序列3和4的核苷酸所示的RNA或具有该序列的RNA；三个所述Oligo DNA序列为序列表的序列5、6和7或具有该...
中国科学院华南植物园关于植物DNA甲基化的调控研究获进展
植物 蛋白质 遗传
2024/6/2
DNA甲基化是表观遗传修饰的重要组成部分，可以通过改变染色质的结构、DNA的稳定性以及DNA和蛋白质的结合程度调控基因表达。在植物DNA甲基化的建立和维持过程中，植物特有的RNA聚合酶V（Pol V）通过转录出的非编码RNA招募一系列下游因子以实现对DNA的甲基化。目前，以Pol V为核心的DNA甲基化复合体已被鉴定出多个组分成员，但作为复合体核心Pol V的转录行为如何调控却不清楚。此外，鲜有关...