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转录因子在染色质上的单次驻留时间通常为几秒至几十秒。驻留时间的动态变化会影响基因转录或染色质高级结构。使用甲醛交联来固定细胞核中蛋白质-DNA相互作用的染色质免疫共沉淀（ChIP）技术是检测转录因子在染色质上驻留水平的常用方法。然而，通常持续10分钟的甲醛交联会以累积的方式固定短时的转录因子-DNA相互作用，从而扭曲转录因子在不同结合位点驻留时间的差异，扰乱对转录因子真实驻留水平的测定。在未经任何...
华中农业大学棉花团队提出植物转录调控演化研究的新观点（图）
植物转录 调控演化 染色质结构
2024/1/20
2023年12月8日，华中农业大学棉花团队受邀在植物学杂志Trends in Plant Science上发表综述论文“Evolutionary insights into the organization of chromatin structure and landscape of transcriptional regulation in plants”。
北京基因组所（国家生物信息中心）发布空间转录组综合资源存储库CROST（图）
综合资源 分析 细胞
2023/11/21
2023年10月9日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心合作开发的空间转录组综合资源存储库（CROST）正式上线，该研究成果以“CROST: a comprehensive repository of spatial transcriptomics”为题在国际学术期刊Nucleic Acid Research 在线发表。
2023年2月8日，中国科学院上海有机化学研究所研究员王婧与中科院院士俞飚研究团队、研究员房鹏飞，联合上海交通大学医学院附属仁济医院研究员冯海忠，在《美国国家科学院院刊》（PNAS）上，在线发表了题为《特异抑制自噬关键转录因子TFEB的小分子化合物研发》的最新研究成果。该工作首次报道了具有明确作用机理、高效抑制自噬关键转录因子TFEB（transcription factor EB）的小分子化合物...
我国科学家成功获得长春花叶片单细胞转录组图谱
长春花叶片 单细胞 转录组图谱
2024/1/23
长春花为夹竹桃科长春花属植物，在中草药用途上，全草入药有止痛、消炎等功效。单萜类吲哚生物碱（MIAs）是植物中最多样的特殊代谢产物，具有重要的药用价值。长春花能够合成130多种MIAs，是研究单萜吲哚生物碱合成的模式药用植物，其所含生物碱，如长春花碱、长春新碱等被用来临床治疗白血病、霍奇金淋巴瘤等，在药用植物研究领域备受关注。
分子动力学研究亚铁血红素激活蛋白转录激活机理
分子动力学 转录激活 柔性 亚铁血红素激活蛋白
2009/11/13
以3种亚铁血红素激活蛋白(Heme activator protein, HAP)-DNA 复合物(野生型HAP1-wt, Ser63/Arg63突变HAP1-18 和 Ser63/Gly63突变HAP1-PC7)为对象对亚铁血红素激活蛋白的转录激活机理进行了分子动力学研究. 对3个复合物分子动力学轨迹的比较性分析显示, 涉及到上游活化序列(Upstream activation sequence...