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Expressed genes and their new alleles identification during fibre elongation reveal the genetic factors underlying improvements of fibre length in cotton
棉花 纤维伸长 表达基因簇
2024/4/16
本研究对亲本海7124、中棉所36及47个子代纤维发育5，10和15天的转录组数据分析，鉴定到35420个表达基因，构建了纤维伸长相关动态表达调控网络，其中10366个表达基因在子代中产生新等位基因（ENAs）；进一步鉴定到7个时空特异调控表达基因簇，差异表达分析筛选到105个候选基因，包含15个新等位基因。CRISPR-cas9系统敲除GhMAH1使纤维显著变短。本研究为解析陆海群体纤维长度变异...
Transcriptome and QTL analyses reveal candidate genes for fiber quality in Upland cotton
棉花 纤维发育 QTL 转录组 表达基因
2024/5/17
本研究基于前期得到的1个F2群体、1个重组自交系群体和2个永久回交群体得到了15个在多群体或者多年分稳定检测的QTL位点。基于转录组测序，在两亲本间发育10天的纤维进行差异基因鉴定，得到了780个差异基因。通过对QTL和转录组结果联合分析，在9个QTL区间内得到31个基因，其中有9个在纤维中优异表达的基因。在这9个基因中，有7个基因在纤维伸长期高量表达，2个基因在纤维次生壁加厚期高量表达。该研究为...
The Candidate Genes Underlying a Stably Expressed QTL for Low Temperature Germinability in Rice (Oryza sativa L.)
Rice Low temperature germinability Quantitative trait locus Candidate gene Genomewide association study
2023/4/21
Background: Direct seeding is an efficient cultivation technique in rice. However, poor low temperature germinability (LTG) of modern rice cultivars limits its application. Identifying the genes assoc...