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系统发育群落生态学是近年兴起的一个重要生态学研究分支, 它以群落生态学为基础并引入了系统发育的分析方法, 全面动态地反映了群落中物种内和物种间的相互作用关系, 揭示了群落格局形成的生态学过程, 研究了生物多样性的形成及维持机制。巴拿马BCI (Barro Colorado Island)样地的成功例子说明, 在固定样地进行长期的群落生态与系统发育研究切实可行且极具意义; DNA条形码的快速兴起对这...
甘露醇对拟南芥基因组DNA甲基化的影响
拟南芥 DNA甲基化 甘露醇 MSAP
2011/11/7
以拟南芥(Arabidopsis thaliana)为材料, 研究不同浓度甘露醇处理下拟南芥幼苗生长发育及其基因组DNA的甲基化水平和变化模式。结果表明, 用50、100、150和200 mmol·L―1甘露醇处理拟南芥种子会对拟南芥幼苗的形态特征和生长态势产生影响; 甲基化敏感扩增多态性(methylation-sensitive amplification polymorphism, MSAP...
对锦葵科植物样品的ITS、ITS2、rbcL、matK和psbA-trnH序列进行PCR扩增和测序, 比较各序列的扩增效率、测序成功率、种内和种间变异的差异以及barcoding gap图, 使用BLAST1和Nearest Distance方法评价不同序列的鉴定能力, 进而从这些候选序列中筛选出较适合锦葵科植物鉴别的DNA条形码序列。结果表明, ITS序列在采集的锦葵科植物11个种26个样品中的...
西双版纳热带植物园开发出一项植物DNA短序列测序新技术
版纳植物园 植物 DNA
2010/3/5
在以往的研究中，针对短测序片段（short read sequence,SRS）进行的比较基因组分析多数都需有事先组装好的DNA序列作为参照，这一定程度上制约了这类数据在生物信息学研究的发展。近期，版纳植物园生态进化组的Cannon教授和其组员发明了一种新的研究方法，该方法不用事先组装，通过分析检测数据中达到某种“复杂度”的基因片段是否存在及其出现频次，来探讨一定数量目标基因组中的序列差异。该研究...
植物DNA条形码项目滇东南石灰岩地区野外考察完成
植物 DNA条形码
2010/3/2
近日，在依托大科学装置的重大研究项目——“植物DNA条形码研究”的支持下，来自中国科学院昆明植物研究所、植物研究所（北京）、华南植物园、西双版纳植物园、江苏省中国科学院植物研究所、浙江大学、华东师范大学、上海交通大学和深圳仙湖植物园等9个科研单位和高校共24位专家和学者组成的考察队，对滇东南进行了为期半个月的冬季科学考察。此次考察由种质资源库采集部组织，中科院昆明植物研究所税玉民博士担任考察队队长...
多基因植物表达载体用于植物遗传转化是培育具有多种优良品质作物的有效策略. 双T-DNA系统是实现筛选完成后选择标记基因删除的一种简便可行的方式. 为培育高度抗逆或去除标记基因的农作物，构建了多基因双T-DNA植物表达载体2T-bbgdD，其中含有一个抗除草剂基因bar, 3个抗逆相关基因(DREB1A, Na+依赖性Pi转运体基因（d5）, betA)和一个报告基因gfp. 利用农杆菌介导法将该载...
太白红杉总DNA的提取及鉴定
太白红杉 总DNA抽提 抗氧荆和螯合剂蛆合提取DNA 法 RAPD(随机扩增多态性DNA)
2009/11/4
用抗氧荆和螯合荆蛆合的方法，成功地从太白虹杉的叶组织中提取和纯化了总DNA 并时其
产率、质量和纯度作了鉴定。用此方法能有效地去除酚类化合物、多糖、萜粪化合物和未知化合物的干扰，为太白虹杉的分子生物学研究提供了一套迅速、经济和可靠的技术方案。
烟草雌、雄配子DNA含量变化
烟草 精细胞 卵细胞 DNA 含量
2009/10/15
采用显微分光光度法测定了烟草( Nicotiana tabacum) 精细胞和卵细胞的DNA 含量。烟草是二胞花粉, 花粉萌发后生殖细胞在花粉管中分裂形成精细胞。授粉后45 h 花粉管到达子房, 在花粉管内的精细胞DNA 含量为1C。当花粉管在退化助细胞中破裂, 释放出的两个精细胞开始合成DNA。在与卵细胞融合前,两个精细胞DNA 含量接近2C。随着精细胞的到达及合成DNA, 卵细胞也开始合成DN...
植物DNA条形码研究进展
DNA条形码 物种识别 分析方法 条形码评价
2009/9/22
DNA条形码(DNA barcoding)已成为近5年来国际上生物多样性研究的热点, 即通过使用短的标准DNA片段, 对物种进行快速、准确的识别和鉴定。该技术在动物研究中已得到广泛的应用, 所采用的标准片段是线粒体COI基因中约650 bp长的一段。然而在植物中DNA条形码的研究进展相对缓慢, 目前尚处于对所提议的各片段比较和评价阶段, 还未获得一致的标准片段。由于植物中线粒体基因组进化速率较慢,...
植物DNA条形码研究在昆明启动
植物 DNA条形码 昆明
2009/9/9
近日，依托国家大科学装置——种质资源库开放研究项目“植物DNA条形码研究”项目启动会在昆明举行。该项目总投资1500万元。
虎耳草属山羊臭组的界定和系统发育: 核糖体DNA ITS序列证据
界定 ITS序列 系统发育 虎耳草属山羊臭组
2009/8/4
虎耳草属Saxifraga山羊臭组sect. Ciliatae是该属中最大的一个组, 共有175种, 主要分布在喜马拉雅地区, 我国分布有166种, 占总种数的95%; 其中, 112种为中国特有。约80%的种类分布在我国青藏高原和西南地区, 是中国喜马拉雅植物成分的代表类群。山羊臭组内物种分化十分显著, 分类处理也很困难, 该组是否为单系类群, 组下的系统发育关系也不清楚, 均需进一步验证。本...
根据叶绿体ndhF和核核糖体DNA序列推断梓属(紫葳科)的系统发育
Bignoniaceae Catalpa eastern Asia-North America ndhF gene nrDNA ITS sequences Phylogeny West Indies
2009/8/4
Phylogenetics of Chilopsis and Catalpa (Bignoniaceae) was elucidated based on sequences of chloroplast ndhF and the nrDNA ITS region. In Bignoniaceae, Chilopsis and Catalpa are most closely related as...
基于核基因ITS和叶绿体基因rpl16、trnS-trnR的DNA序列讨论了锥形果属的系统位置, 3个基因片段独立以及联合的分析为锥形果属Gomphogyne的系统进化研究提供了足够的信息。结果表明: (1)锥形果属是一个自然属; (2)雪胆属Hemsleya的短柄雪胆H. delavayi和圆锥果雪胆H. macrocarpa曾经被作为锥形果属的种, 分子证据表明它们确实隶属于雪胆属; (3)锥...
横断山地区是许多温带植物的冰期避难所。为揭示该地区分布物种的亲缘地理结构, 检测了该地区特有、分布相对较为普遍的偏花报春Primula secundiflora的叶绿体trnL-trnF和rps16区序列变异。研究了11个居群109个个体, 一共发现了15种单倍型。只有一种单倍型为3个居群所共有, 其他单倍型都只存在于单个居群内。总的遗传多样性较高(HT=0.966), 但居群内遗传多样性较低(...
由于青藏高原的地貌效应,第四纪冰期气候的反复变化应对现今该地区生物的地理分布及其居群遗传结构产生重大影响。本文对这一地区特有分布物种祁连圆柏Juniperus przewalskii Kom.整个分布区内20居群392个个体的trnT-trnF序列变化进行了研究;共发现3种单倍型(haplotype),构成两种地理区域:高原台面上的居群主要固定Hap A,而Hap A、Hap B和Hap C在高原...