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研究发现植物DNA甲基化和H3K9me2之间的新关联（图）
植物 DNA甲基化 H3K9me2
2018/11/23
2018年10月31日，《自然-通讯》（Nature Communications）杂志在线发表了中国科学院分子植物卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组和杜嘉木研究组合作完成的题为Arabidopsis AGDP1 links H3K9me2 to DNA methylation in heterochromatin 的研究论文。染色质根据不同的功能，分为更加容易...
表观遗传修饰尤其是DNA甲基化和组蛋白修饰在基因表达调控中起重要“开关”作用。前期研究证实蒺藜苜蓿(Medicago truncatula) MtMYBS1是参与植物盐胁迫应答的重要功能基因。本文采用反转录PCR (RTPCR)、重亚硫酸盐测序PCR (BSP)和染色质免疫沉淀(ChIP)等技术分析了MtMYBS1在盐胁迫过程中的表达、DNA甲基化及组蛋白修饰状态。盐胁迫下伴随着MtMYBS1的上...
以菊花的扦插生根苗为试材, 在缺氮和适氮水培条件下, 分别使用甲基化抑制剂(5-azaC)和甲基供体(SAM)处理菊花根系, 测定处理后基因组DNA甲基化水平变化、根系构型相关参数、根系硝态氮含量以及NO3-转运蛋白基因CmNRT1.1、CmNRT2.1、CmNAR2.1的相对表达量。结果表明, 在适氮条件下, 5-azaC处理的菊花根系DNA甲基化水平降低, 根系总直径、总表面积及总体积增大; ...
种子活力和DNA甲基化关系的研究进展
种子活力 DNA甲基化 激素 表观遗传
2018/11/22
种子活力在发育中逐渐形成, 成熟期随着水分的减少, 种子获得最大活力。期间发生了许多重要的生理生化反应, 如营养物质大量积累、酶和mRNA的钝化等, 为种子活力的保持和萌发做好准备。植物中有20%~30%的核基因组DNA胞嘧啶处于甲基化状态, DNA甲基化可以调节基因的表达, 维持植物基因组稳定。而植物的DNA甲基化状态在不同器官、不同组织、甚至发育的不同阶段都是不同的, 这与遗传和外界环境的刺激...
对山葡萄(Vitis amurensis)种质资源样品的ITS、ITS2、psbA-trnH、rbcL和matK序列进行PCR扩增及测序, 优化PCR反应的退火温度, 比较各序列的扩增效率、测序成功率、品种间和品种内的差异及barcoding gap图, 使用BLAST和NJ树法比较不同序列的鉴定能力, 最终从5条DNA片段中筛选出可用于山葡萄种质资源鉴定的DNA条形码通用序列。结果表明, 在采集...
中国科学院上海植物逆境生物学研究中心张蘅研究组揭示染色质重塑因子PKL在RNA介导的DNA甲基化中的功能（图）
中国科学院上海植物逆境生物学研究中心 张蘅研究组 染色质 重塑因子PKL RNA介导 DNA甲基化
2017/6/9
2017年5月31日，Genome Biology杂志在线发表了中国科学院上海植物逆境生物学研究中心张蘅研究组题为“The developmental regulator PKL is required to maintain correct DNA methylation patterns at RNA-directed DNA methylation loci”的研究论文。该研究揭示了染色质重...
2017年5月15日，《美国科学院院刊》（PNAS）在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心朱健康研究组和郎曌博研究组题为Critical roles of DNA demethylation in the activation of ripening-induced genes and inhibition of ripening-repressed genes in tom...
依据科技部《科学技术评价办法》的有关规定，中科合创（北京）科技成果评价中心（第三方专业科技成果评价机构）按照科技成果评价的标准及程序，本着科学、独立、客观、公正的原则，昆明植物研究所于2017年5月5日组织了来自云南省林业科学院、西南林业大学、云南大学、中国科学院昆明动物研究所、中国科学院西双版纳热带植物园、云南省对外科技合作协会的七位专家对由李德铢研究员组织完成的“中国植物DNA条形码研究” 科...
樟科植物作为常见的重要经济林木，在林业、轻工、医药等领域都占有重要的地位，大多数种类集中分布于长江以南各省区，然而对其物种的把握与识别却始终是困扰大家的一个难题，阻碍了对其实施有效的生物多样性保护与开发利用。物种的准确鉴定是一切生产、应用与研究至关重要的第一步，DNA条形码技术的应用，使得前述难题都有方法可循。为了探寻与评估DNA条形码技术对这一难题的解决能力，中国科学院西双版纳热带植物园植物系统...
一个参与拟南芥DNA去甲基化过程候选基因的定位与功能分析
拟南芥 rll1 图位克隆 DNA去甲基化
2018/12/26
以转基因拟南芥(Arabidopsis thaliana) Col-LUC为亲本材料, 把它的种子进行甲基磺酸乙酯(EMS)诱变, 在M2代幼苗中筛选出一株荧光降低的候选突变体, 命名为rll1 (reduced LUC luminescence 1), 此突变基因对应的野生型基因位点因此被命名为AtRLL1位点。该突变体在生长发育方面表现出明显矮化、角果较短、叶片较小的发育缺陷表型。遗传学分析表...
鸢尾兰属是分布于旧世界热带地区的一类附生兰科植物。全世界约150-200种，中国分布有44种2变种，该属植物均被评估为濒危物种并列入了濒危动植物国际贸易公约和IUCN红色名录。近年来，随着生境的破坏、人为采集以及不合法的动植物交易，鸢尾兰属植物也面临着濒临灭绝的威胁，尤其是一些狭域分布的种类。因此，厘清该属的属下关系以及快速地对该属植物进行分类鉴定，对于物种的保护具有极为重要的意义。鸢尾兰属自建立...
2016年12月9日，《细胞研究》（Cell Research）杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为A pair of transposon-derived proteins function in a histone acetyltransferase complex for active DNA demethylation 的研究论文。该研究利用...
应用SELEX技术检测水稻RFL转录因子的DNA结合位点
水稻 转录因子 SELEX DNA结合位点
2018/6/28
FLORICAULA/LEAFY是植物特有的转录因子, 其可以通过调控下游基因的表达对植物的发育起到调控作用。水稻(Oryza sativa)中的同源基因RFL (Rice FLORICAULA/LEAFY)能够调控多个发育过程, 包括开花、叶间期以及枝梗和颖花分化。指数富集配体的系统进化(SELEX)技术已经被广泛应用于体外筛选转录因子的DNA结合位点。应用SELEX技术检测水稻RFL的DNA结...
SSR又称为微卫星序列，是一种由几个核酸为重复单位的DNA序列，广泛分布于动植物DNA中，在种内和种间群的遗传中具有多样性，因此广泛应用于DNA的barcoding、SSR分子标记开发、分子育种、物种资源与个体鉴定。随着越来越多的基因组序列和转录组序列的产生，海量DNA序列的应用与开发成了一个关键的瓶颈。
植物多倍化与DNA甲基化关系的表观遗传学研究获进展（图）
多倍化 DNA甲基化 表观遗传学
2015/12/7
多倍化又称全基因组重复，在植物、动物和真菌中都经常发生。所有被子植物在进化过程中都至少经历过一次多倍化事件，显示出多倍化事件在植物进化中起到的关键作用。多倍化事件产生了大量新的遗传材料，增加了基因组复杂性，为现存植物的成功进化提供了重要基础。多倍化会给基因组造成强烈的冲击和长期深远的影响，多倍化事件发生后植物基因组的进化是一个动态的过程。因此，可以将多倍化事件发生后基因组的进化视为基因组对多倍化事...