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研究揭示细胞核内mRNA出核或降解命运决定的时空性
细胞核内 mRNA出核 命运决定 时空性
2018/8/1
2018年7月19日,国际学术期刊Nucleic Acids Research在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所程红研究组的最新研究成果“mRNAs are sorted for export or degradation before passing through nuclear speckles”,揭示了mRNA 出核和降解命运决定的时空性。
细胞通过控制信使RNA(mRNA)降解在任何给定的时间里控制特定蛋白的数量。鉴于mRNA的核苷酸尾巴在这个过程中起作用,在一项新的研究中,来自韩国基础科学研究院(IBS)RNA研究中心的研究人员鉴定出由不同核苷酸组成的混合尾巴(mixed tail)如何保护mRNA在更长的时间内免受降解。这些发现可能为理解基因调节在健康和疾病状态下的作用提供新的见解。相关研究结果于2018年7月19日在线发表在S...
以抗逆性较强的荒漠植物花花柴为材料, 利用数字基因表达谱技术对用质量百分数20%的PEG溶液处理0、4、8、12和24 h后的花花柴幼苗的mRNA-Seq测序结果进行分析。结果表明, 花花柴幼苗叶部在不同处理时间均上调表达的基因有122个, 下调表达的基因54个, 根部在不同处理时间均上调表达的基因73个, 下调表达的基因79个。利用qRT-PCR和RT-PCR对可能与花花柴耐旱相关的6个差异表达...
Tissue Specific Splicing of Pre-mRNA Porcine Mitochondrial Transcription Factor A
pig mitochondrion mitochondrial biogenesis splicing forms expression
2018/3/5
Mitochondrial transcription factor A plays, due to its role in replication and transcription of the mitochondrial
DNA, an important role in mitochondrial biogenesis and regulation of its activity. In...
北京大学化学与分子工程学院何川/贾桂芳课题组发现植物mRNA化学修饰m6A去甲基酶并揭示其对植物开花时间的调控功能(图)
北京大学化学与分子工程学院 何川 贾桂芳 课题组 植物mRNA化学 m6A去甲基酶 植物开花时间
2018/1/18
近期,北京大学化学与分子工程学院的何川/贾桂芳课题组在高等植物N6-甲基腺嘌呤(m6A)动态可逆调控的研究中取得重要进展,相关工作以“ALKBH10B is An RNA N6-Methyladenosine Demethylase Affecting Arabidopsis Floral Transition”为题,发表在The Plant Cell (DOI: https://doi.org/...
中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所程红研究组的最新研究成果,以Exosome cofactor hMTR4 competes with export adaptor ALYREF to ensure balanced nuclear RNA pools for degradation and export为题,在线发表在EMBO Journal上,研究揭示了hMTR4 和ALY...
中国科学院上海生命科学研究院等揭示mRNA出核接头蛋白ALYREF在基因组范围内的结合位点及招募新机制
中国科学院上海生命科学研究院 mRNA出核接头蛋白ALYREF 基因组 结合位点 招募机制
2017/12/21
中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所程红研究组的最新研究成果,以ALYREF mainly binds to the 5΄ and the 3΄ regions of the mRNA in vivo为题,在线发表在Nucleic Acid Research上。该研究发现在哺乳动物细胞中mRNA出核接头蛋白ALYREF主要结合在mRNA的5’和3’区域,并揭示...
【目的】 RBP1是一种参与黑腹果蝇Drosophila melanogaster性别决定基因doublesex(dsx)pre-mRNA选择性剪接的重要剪接因子。本研究旨在克隆RBP1基因在西方蜜蜂Apis mellifera中的同源基因AmRBP1,分析其结构域及其在西方蜜蜂性别决定初期胚胎和幼虫不同发育阶段中的表达模式,以期为研究该基因是否参与蜜蜂性别决定奠定基础。【方法】基于NCBI中提交...
基因组中同义密码子的使用频率存在差异,这一现象被称为密码子使用偏好。基因表达水平与密码子使用偏好之间的正相关关系已被广泛报道。传统观点认为,对翻译速率和翻译准确性的自然选择导致了这一相关关系。然而,另一种可能的机制——密码子使用偏好对mRNA水平的调控作用却被长期忽略。中国科学院遗传与发育生物学研究所钱文峰研究组在酵母中合成了3556个GFP和523个TDH3的同义密码子突变体,发现同义密码子的使...
近日,分子演化领域权威期刊Molecular Biology and Evolution在线发表了题为“Isoform Evolution in Primates Through Independent Combination of Alternative RNA Processing Events”的研究工作。北京大学分子医学研究所李川昀研究员担任通讯作者,张仕坚博士、王晨曲博士担任共同第一作者...
无义介导的mRNA降解通路(Nonsense-mediated mRNA decay,NMD)是真核生物细胞中重要的mRNA质量监控通路,能够识别和降解含提前终止密码子(Premature terminal codon,PTC)的转录本,从而抑制这些异常mRNA的翻译产物对细胞造成的潜在损伤。对从单细胞酵母到多细胞动植物的NMD通路的研究表明:不同物种NMD通路的组成因子及对PTC的识别机制有一定...
中国科学院上海生命科学研究院(人口健康领域)科研人员研发了pre-mRNA可变剪接分析软件CASH
中国科学院上海生命科学研究院 人口健康领域 科研人员 pre-mRNA 可变剪接 分析软件 CASH
2017/4/18
2017年4月6日,国际著名生物信息学期刊Briefings in Bioinformatics在线发表了中国科学院上海生命科学研究院(人口健康领域)冯英组和浙江农林大学吴文武博士,上海列冰生物科技有限公司宗杰博士的最新研究进展“CASH: a constructing comprehensive splice site method for detecting alternative splic...
Forty Years of mRNA Splicing: From Discovery to Therapeutics
Biology of Spliceosome Spliceosome Complexes
2017/4/5
The discovery of mRNA splicing in 1977 established a new step in the central dogma of molecular biology, the “flow” of genetic information from DNA to RNA to protein product. Our meeting will focus on...
近日,生命科学学院巴雪青教授和曾宪录教授研究团队关于真核基因表达的转录后水平调节机制的研究取得了突破性进展,相关研究成果以“PARP1 promotes gene expression at the post-transcription level bymodulating the RNA-binding protein HuR”为题,于3月8日发表于国际著名期刊[自然通讯](NATURE COM...
Dynamic expression of HSP90B1 mRNA in the hypothalamus of two Chinese chicken breeds under heat stress and association analysis with a SNP in Huainan chickens
heat shock protein mRNA level single nucleotide polymorphism thermal stress
2017/2/21
The effects of heat stress on HSP90B1 messenger RNA (mRNA) expression in the hypothalamus of chicken were investigated and HSP90B1 variations were detected. Females of two Chinese chicken breeds (Huai...