搜索结果: 1-4 共查到“RAD-seq”相关记录4条 . 查询时间(0.125 秒)
中国科学院西双版纳热带植物园（以下简称“版纳植物园”）植物系统发育与多样性保护研究组选取黄杞（Engelhardia roxburghiana）为研究物种，利用生物信息学软件STACKS，探索使用不同参考基因组对SNP Calling的影响。该研究围绕两种不同参考基因组：使用近缘种（即枫杨：Pterocarya stenoptera）作为参考基因组，以及利用物种本种（即黄杞）作为参考基...
基于RAD-seq数据开发烟草多态性SSR标记
烟草 RAD-seq SSR标记 多态性
2019/8/14
采用RAD-seq技术对两份烟草材料"118-3"和"粤烟98"进行简化基因组测序，分别获得45 119 346和50 360 738个高质量干净读长（HQ clean reads）。通过序列分析，在22 145个reads覆盖的参考基因组序列中共检测到25 343个SSR位点，其中以二和三核苷酸重复基序最为丰富，占总SSR位点的71.59%；除单核苷酸类型外，SSR基序的重复次数主要集中在4~9...
本研究旨在评价基因库与保种场两个鹿苑鸡保种群的保种现状。利用RAD-seq简化基因组测序鉴定基因库与保种场两个鹿苑鸡群体的SNP标记，通过计算遗传统计量，比较分析两个群体的遗传差异。结果，经过两步数据质控，在基因库与保种场两个鹿苑鸡群体中分别鉴定出SNPs标记395 021个和428 314个，两个群体的平均杂合度Ho分别为0.211 1和0.206 8，群体间的遗传分化系数Fst为0.005 6...
RAD-seq技术在基因组研究中的现状及展望
RAD-seq 基因组 遗传图谱 SNP 双酶系统的RAD(ddRAD)测序
2014/2/5
Restriction-site associated DNA sequencing(RAD-seq)技术是在二代测序基础上发展起来的一项基于全基因组酶切位点的简化基因组测序技术。该方法技术流程简单, 不受有无参考基因组的限制, 可大大简化基因组的复杂性, 减少实验费用, 通过一次测序就可以获得数以万计的多态性标记。目前, RAD-seq技术已成功应用于超高密度遗传图谱的构建、重要性状的精细定位、...