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四川麻鸭mtDNA全序列的克隆和生物信息学分析
线粒体基因组 四川麻鸭 遗传进化
2017/4/1
本研究旨在获得四川麻鸭线粒体DNA基因组全序列（mtDNA），为该遗传资源的保护与利用提供参考。研究参照近缘物种线粒体基因组序列，用Primer 6.0设计引物16对，采用PCR克隆测序技术获得四川麻鸭mtDNA基因组序列。结果表明，四川麻鸭mtDNA基因组全长16 604 bp，碱基组成为A（29.19%）、C（32.82%）、G（15.79%）、T（22.20%），包含22个tRNA基因、2个...
Application of mtDNA markers for European huchen (Hucho hucho Linnaeus, 1758) management in Poland
Salmonidae broodstocks conservation genetic structure mtDNA
2015/12/17
Four broodstocks of European huchen (Hucho hucho) from Poland, Germany, Slovakia, and Ukraine were investigated using five selected fragments of mtDNA. The mitochondrial DNA sequence analysis was succ...
鸡mtDNA D-loop区单倍型簇频率与中国家鸡多母系起源研究
家鸡 mtDNA D-loop区 单倍型 聚类分析 频率 起源
2016/12/26
本研究旨在通过分析家鸡和原鸡D-loop区单倍型簇的区域性分布和频率揭示中国家鸡多母系起源的区域和传播途径。通过对1 347条鸡D-loop序列进行完全对比排序，共发现198种单倍型，聚成12个单倍型簇。分析结果显示，海岛型红色原鸡与家鸡和大陆型红色原鸡有明显差异；苏门答腊大陆型红色原鸡作为独立分支，也体现出与东南亚大陆型红色原鸡的区别。单倍型簇频率分析显示，Clade C代表的母系可能更早在东南...
西藏牦牛mtDNA cytb基因的序列多态性及其系统进化分析
西藏牦牛 细胞色素b基因 遗传多样性 系统进化
2013/11/29
为从分子水平上探究西藏牦牛类群的亲缘关系、分类地位和遗传多样性，本研究测定了嘉黎牦牛、桑桑牦牛、桑日牦牛、工布江达牦牛、斯布牦牛、帕里牦牛、康布牦牛、江达牦牛、类乌齐牦牛、丁青牦牛、巴青牦牛等11个西藏牦牛类群共110头牦牛的细胞色素b基因全序列，分析了其多态性，并构建了11个类群的系统进化树。结果表明：11个西藏牦牛类群的细胞色素b基因全序列长均为1 140 bp，共有单倍型53种，其中新发现的...
家鸭、媒鸭和野鸭mtDNA D-loop区的遗传变异
鸭 D-loop 遗传多样性 系统进化
2013/12/3
旨在从mtDNA水平探讨我国家鸭的遗传多样性及家鸭与野鸭间的亲缘关系。运用DNA测序方法，测定了不同地域、水域和表型性状的9种家鸭（北京鸭、高邮鸭、巢湖鸭、绍兴鸭、连城白鸭、吉安红毛鸭、文登黑鸭、云南麻鸭、建昌鸭）80个个体、4 种媒鸭（西湖野鸭、钱江野鸭、枞阳媒鸭、媒头鸭）26个个体和斑嘴鸭8个个体，共计114个个体的mtDNA Dloop区 667 bp序列。9种家鸭单倍型多样度和核苷酸多样...
中国斗鸡mtDNA遗传多样性及起源研究
斗鸡 细胞色素b 遗传多样性
2009/11/3
本研究旨在探究中国斗鸡的遗传多样性和起源。运用DNA测序的方法测定了河南斗鸡、鲁西斗鸡、吐鲁番斗鸡、西双版纳斗鸡和漳州斗鸡5个斗鸡品种40个个体的mtDNA细胞色素b（Cytb）的部分碱基序列(535 bp)。结果表明，这5个斗鸡品种共有6种单倍型；单倍型多样度为0.428 57～0.785 71；核苷酸多样度为0.000 80～0.006 54；漳州斗鸡与其它斗鸡的遗传距离均较远；基于单倍型构建...
本研究旨在分析mtDNA ND4基因在中国西南马的遗传多样性。对中国西南马6个品种（类群）142个个体的线粒体DNA ND4基因部分序列进行PCRSSCP和序列分析。结果表明，拼接后的西南马mtDNA ND4 基因序列大小为679 bp，A+T含量（55.7%）高于G+C含量（44.3%）。共检测到11个核苷酸变异位点，这些变异位点可归纳为6种单倍型。核苷酸平均多样度为0.638%，表明受试西南...
云南文山黄牛mtDNA D-loop区遗传多样性分析
云南文山 黄牛 mtDNA D-loop区 遗传多样性
2009/10/21
云南文山黄牛mtDNA D-loop区遗传多样性分析。
贵州白山羊与湖南马头山羊mtDNA Cytb基因系列比较及系统进化研究
山羊 线粒体 DNA 细胞色素b 遗传多样性
2009/9/17
［目的］为了从核酸序列水平上分析2个山羊线粒体DNA Cytb基因的遗传多样性及系统发生地位。［方法］对贵州白山羊及马头山羊2个山羊品种，共计27个个体mtDNA Cytb基因片段进行测序分析和比较。［结果］ 26条山羊的Cytb基因序列均为1 140 bp的同源基因序列；总共发现12个变异位点，观察到10种单倍型；2个山羊品种中单倍型多样性为0.635%~0.889%，核苷酸多样度为...
为了研究甘肃地方绵羊品种mtDNA D环序列遗传多样性与起源，利用设计的1对引物对绵羊mtDNA D环序列进行PCR扩增和纯化测序。对序列数据进行单倍型、遗传多样性、系统发育树和网络关系分析。分析结果显示：120只绵羊mtDNA D环序列（部分）表现出2种长度变异，其中3个序列长度为573 bp，117个序列长度为648 bp。对117个长度为648 bp的序列进行分析，发现77个单倍型。单...
【目的】利用mtDNA CytB基因为标记，从分子水平探讨12个猪种166个样本（8个山东省猪种，3个引进猪种和梅山猪种）的遗传多样性和各猪种间的亲缘关系，为山东省猪种合理利用以及生物多样性保护提供基础资料。【方法】对各猪种样本mtDNA CytB基因进行PCR扩增和测序，采用现代生物信息学方法进行数据处理分析。【结果】山东8个猪种种内遗传变异和种间遗传距离均较小，有共享单倍型。山东各猪种和梅山猪...
［目的］研究分析了贵州黑山羊mtDNA Cytb基因的遗传多样性，为贵州黑山羊遗传资源的保护、开发及利用奠定分子遗传学方面的基础。［方法］测定贵州黑山羊品种16个个体的细胞色素b基因全序列，分析其碱基成和序列间碱基的变异。［结果］在该品种(群体)中观察到6次TC间发生碱基转换，其中有5个碱基替换发生在密码子第3位点，有1个碱基替换发生在密码子第1位点，且所有的变异均为同义突变；观察到4种单倍型。...
新疆野猪mtDNA控制区序列遗传多样性分析
新疆野猪 mtDNA控制区序列 遗传多样性
2009/6/8
［目的］为研究猪种起源和遗传分化提供依据。［方法］从6 个新疆野猪样本中提取基因组DNA，克隆线粒体DNA 控制区序列
并进行测序。在测定新疆野猪与其他20个国内外猪种间的遗传距离的基础上，对其进行聚类分析。［结果］通过PCR扩增克隆到大小
为1398 bp的DNA片段，其A+T含量为59.87%，有明显的碱基偏向性。控制区内存在大量的ACACGTGCGT串联重复序列。在6 个新
疆野猪样...
通过线粒体DNA控制区的结构和多态性来研究中国家鸡和红色原鸡的遗传多态性与系统进化。测定14个中国地方鸡种和红色原鸡2个亚种的256个个体线粒体DNA控制区部分序列约560 bp，结果表明，A、C、G、T这4种核苷酸的平均比例分别为25.00％、37.40％、4.40％和33.20％。共发现44个变异位点，约占分析位点总数的7.86％，没有观测到插入/缺失，颠换和转换之比为 0.13；共具有32种...