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分类学,生命科学的基石,致力于精确界定物种边界,赋予生物科学命名,构建反映生物间亲缘关系的自然分类系统,以增进我们对生命演化历程的认知,推动生物资源的保护和可持续利用。在这一领域,分类学者需对生物个体的形态性状进行精密观察,掌握其变异规律,洞察其演化模式,以甄别出“好”的分类性状开展分类工作。然而,很多形态性状复杂多变,并且存在趋同演化和平行演化现象,为物种划分和构建自然分类系统带来了挑战。
椿启介菌科(Tubakiaceae)是间作壳目(Diaporthales)分子系统发育树中独立起源的一支,椿启介菌具有独特的无性型特征,尤其是它们的分生孢子体—盾状分生孢子器(pycnothyria)。该科扩展自其模式属椿启介菌属(Tubakia),部分物种迁移至Apiognomonioides,Involutiscutellula,Oblongisporothyrium,Paratubakia,...
椿启介菌属(Tubakia)是壳斗科植物上常见的间作壳目真菌类群,能引起植物叶斑病和果腐病,或者作为叶片和果实的内生菌或腐生菌存在。在本研究之前,我国壳斗科植物上已经报道了6种椿启介菌,即栓皮栎上的T. americana,锥栗上的T. chinensis,栎属和栗属上的T. dryina,板栗上的T. japonica,沼生栎上的T. lushanensis,以及蒙古栎上的T. seoraksa...
椿启介菌属(Tubakia)是壳斗科植物上常见的间作壳目真菌类群,能引起植物叶斑病和果腐病,或者作为叶片和果实的内生菌或腐生菌存在。在本研究之前,我国壳斗科植物上已经报道了6种椿启介菌,即栓皮栎上的T. americana,锥栗上的T. chinensis,栎属和栗属上的T. dryina,板栗上的T. japonica,沼生栎上的T. lushanensis,以及蒙古栎上的T. seoraksa...
中国科学院植物研究所张宪春研究组对水龙骨科的分类和进化展开了长期研究,在国际同行的支持下,在全球范围内对水龙骨科关键类群进行取样,并通过高通量测序技术获取了代表28属78个物种的叶绿体全基因组数据,覆盖了水龙骨科全部进化分支。在谱系发生重建时,通过数据模拟消除了长枝吸引的影响,得到了迄今为止该科最稳定的系统框架,包含九个分支,分别代表剑蕨亚科(Loxogrammoideae)、鹿角蕨亚科(Plat...
水龙骨科Polypodiaceae是蕨类植物第二大科,也是蕨类植物中最进化的类群。该科多为附生植物,全世界有1600余种,在热带亚洲和热带美洲形成2个分布中心。自20世纪40年代秦仁昌教授首次对水龙骨科进行重新界定以来,该科的范围和科下分类发生了一系列的变动,亚科和属的概念难以统一。水龙骨科植物起源时间较晚并伴随着快速辐射分化,不同分支具有明显的进化速率异质性,由于少数分子片段的信息不足,目前针对...
经过近7年的研究,中国科学院昆明植物研究所植物经典分类与植物多样性研究团队东亚特征成分研究组与日本、美国同行进行深度合作,对东亚鼠尾草物种进行了系统的研究(Hu et al., 2013, 2016, 2017; Hu & Peng 2015; Xiang et al., 2016; Bryan et al., 2017)。结合野外调查及馆藏标本的研究,团队成员在东亚地区广泛收集鼠尾草属样本共78...
以蓼科Polygonaceae酸模亚科Rumicoideae酸模族Rumiceae大黄属Rheum L.作外类群, 对蓼亚科Polygonideae蓼族Polygoneae 4属19种1变种的trnL-F序列以及16种1变种的matK序列进行了测定(部分序列取自GenBank)和聚类分析, 探讨了虎杖属Reynoutria Houtt.和西伯利亚蓼Polygonum sibiricum Laxm...
应用nrDNA ITS和ETS序列探讨了樟科Lauraceae黄肉楠属Actinodaphne的系统演化关系。对得到的3个序列矩阵(ITS、ETS和ITS/ETS), 采用MP (maximum parsimony), ML (maximum likelihood)和Bayesian 3种分析方法进行了系统发育分析。结果显示, 本文选的黄肉楠属Actinodaphne物种与所选的月桂族中的外类群...
鳞毛蕨属的生物系统学研究。
从栽培的牡丹Paeonia suffruticosa根中分离到7个化合物,它们是芍药甙I,苯甲酰芍 药甙Ⅱ,羟基芍药甙Ⅲ,丹皮酚Ⅳ,丹皮酚甙Ⅴ,丹皮酚原甙Ⅵ和丹皮酚新甙Ⅶ。 用薄层 扫描仪测定了23种芍药科植物(包括19个种和6个变种)根中这7个成分的含量。结果表明 芍药甙在芍药科植物中是普遍存在的,可作为本科的特征性成分; 丹皮酚类成分只存在于木 本类型的牡丹组,在草本类型的芍药...
贝叶斯推论作为进化生物学的最新进展, 在适用复杂模型、大型数据集、计算速度和结果容易解释等方面明显优于其它算法。本文简要介绍了贝叶斯推论原理及其在分子进化和系统发育研究中的重要性,并使用该方法对百合目主要类群的系统发育关系进行了重建。结果显示, 百合目rbcL 基因最适合的DNA进化模型为GTR + I + G, 贝叶斯法与距离法和最大简约法构建的系统发育树拓扑结构相似, 没有显著差异, 但是分辨...
基于61 个广义的形态学性状, 以杨属为外类群对柳属进行了分支系统学分析。经简约性分析, 得到了21 个同等简约的分支树, 其严格一致树支持柳属为一个自然的分类群, 但不支持将钻天柳属和心叶柳属从柳属中划分出去独立成属, 也不支持对柳属进行属级水平上的细分, 后两个结果得到孢粉学和分子系统学研究的支持。柳亚属为一个单系分支, 皱纹柳亚属和黄花柳亚属也形成了一个单系分支。根据本研究的结果, 建议将柳...
对狭义干蘑属( Xerula s . str .) 的范围进行了重新界定, 该属仅包括模式种干蘑( X. pudens) 及其周围的几个种。属的特征是担子果金钱菌状, 有假根; 菌盖及菌柄表面干燥, 被有黄色至褐色直立、披针形的刚毛; 菌褶边缘无不育带; 子实层有近梭形的小担子。这些特征可以将干蘑属的物种从干蘑属- 小奥德蘑属复合群中分开。现知干蘑属包含六种, 本文提供了这些种的检索表, 并对各种...
应用nrDNA Internal Transcribed Spacer ( ITS) 序列, 使用Bayesian 分析法对樟科润楠属的系统学问题进行了初步探讨, 结果表明润楠属在鳄梨属群中本身作为一独立分支, 是一个自然的单系类群; 由于其花被裂片果期宿存且强烈反转与同产自亚洲的楠属和油丹属存在清晰界线。本研究否定了前人依据花被片外面被毛情况及果实大小所建立的润楠属属下系统, 但同时暗示着花序类...

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